Omicron 分析顯示沒有明確證據(jù)表明毒力或致死率增加

2021年1月2日整理發(fā)布：由于其刺突 (S) 蛋白和宿主受體結合域 (RBD) 中存在大量基因組突變，SARS-CoV-2 Omicron 變體被宣布為關注變體 (VOC)。在 Omicron 變體出現(xiàn)后，全球許多國家報告了病 () 病例激增。

Omicron 的一個亞系 BA.2 的出現(xiàn)，其突變略有變化，并且關于 SARS-CoV-2 Omicron 變體的流行病學特征的信息有限，因此需要進行更多的研究。

關于研究

在本研究中，作者對 SARS-CoV-2 Omicron 變體進行了計算機模擬和流行病學相關分析。為此，他們確定了 Omicron 變體突變對宿主-病毒相互作用的功能影響以及 Omicron 相對于特定 SARS-CoV-2 變體的流行病學優(yōu)勢。當前的研究集中在 Omicron BA.1 的當前和最流行的亞系上。

將在硅片分析中使用從上共享所有流感數(shù)據(jù)的全球倡議(全球共享禽流感數(shù)據(jù)倡議組織)最高收集54個國家的Omicron變異的3,604基因組序列，以12月10日，2021年的數(shù)據(jù)是用來確定奧米克的突變對毒性功能的影響、免疫逃逸和病毒傳播。使用 hCoV-19/Wuhan/WIV04/2019 作為突變分析的參考菌株，生成了具有氨基酸變化的 Omicron刺突蛋白的三維 (3D) 結構。RBD 相關突變是使用開放分析管道確定的，該管道將酵母展示平臺與深度突變掃描相結合。該管道確定了與野生型 (WT) SARS-CoV-2 菌株相比，Omicron RBD 的氨基酸突變對血管緊張素轉換酶 2 (ACE2) 結合親和力和蛋白質表達的影響。

隨后，從 2021 年 10 月 1 日至 2021 年 12 月 10 日，對包括 Omicron 在內的 SARS-CoV-2 變異體的基因組序列的相對比例與最近的 病例和來自 SA 的死亡率數(shù)據(jù)進行了比較分析。這種流行病學相關性進行了研究以了解與現(xiàn)有的 SARS-CoV-2 變體相比，Omicron 變體在毒力或傳播性方面是否具有任何流行病學優(yōu)勢。2019 年病 () 的全球流行病學數(shù)據(jù)來自 Worldometer 數(shù)據(jù)庫。

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