腫瘤的生長在很大程度上依賴于某些基因變化，研究人員已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了許多這樣的“基因依賴性”作為潛在的新抗癌藥物的靶標(biāo)。在麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)的博德研究所以及其他地方，研究人員也在了解依賴性如何影響癌細(xì)胞以及它們?nèi)绾蜗嗷ビ绊懖?dǎo)致耐藥性。
但布羅德癌癥項目主任比爾·塞勒斯表示，該領(lǐng)域需要新的方法來尋找依賴關(guān)系，從而開發(fā)出新一類更有效、甚至有治療作用的抗癌藥物。“我們經(jīng)常沒有認(rèn)真思考如何治愈癌癥，”塞勒斯說，他也是布羅德研究所的核心研究所成員，也是丹納法伯癌癥研究所實驗治療學(xué)院長的教員和高級顧問。
自 2018 年以來，由 Broad 發(fā)起的學(xué)術(shù)-工業(yè)合作伙伴癌癥依賴性圖譜 (DepMap) 聯(lián)盟通過系統(tǒng)篩選癌癥模型以尋找遺傳依賴性，發(fā)現(xiàn)了多個潛在的藥物靶點。
作為博德研究所癌癥計劃的一部分，塞勒斯實驗室探索基因改變與癌癥依賴性之間的聯(lián)系，目的是為新療法提供信息。
賣家與我們坐下來討論了當(dāng)前癌癥依賴性研究方法的局限性以及如何才能更接近治愈。
研究人員過去如何尋找癌癥依賴性?
大多數(shù)情況下，人們在基因組規(guī)模上一次敲除一個基因，并問：“失去該基因?qū)Π┌Y生長的功能會產(chǎn)生什么后果?”
最初有兩種方法：基于小發(fā)夾 RNA (shRNA) 的實驗和現(xiàn)在基于 CRISPR 的實驗。這些方法有許多限制。
首先，它們完全是在體外進(jìn)行的，因此它們沒有考慮腫瘤微環(huán)境或宿主中可能提供的任何因素。這很難解決。
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