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蛋白質(zhì)可以幫助彼此與DNA結(jié)合

導(dǎo)讀 東京——東京都立大學(xué)的科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了一種獨(dú)特的機(jī)制,其中兩種轉(zhuǎn)錄因子在裂變酵母中穩(wěn)定彼此與 DNA 的結(jié)合。他們發(fā)現(xiàn),當(dāng) Atf1 和 R

東京——東京都立大學(xué)的科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了一種獨(dú)特的機(jī)制,其中兩種轉(zhuǎn)錄因子在裂變酵母中穩(wěn)定彼此與 DNA 的結(jié)合。他們發(fā)現(xiàn),當(dāng) Atf1 和 Rst2 靠得足夠近時(shí),它們會(huì)幫助彼此穩(wěn)定地結(jié)合。它們都有助于轉(zhuǎn)錄一個(gè)處理葡萄糖貧乏環(huán)境但屬于完全獨(dú)立的激活途徑的基因。像這樣的新見解可以幫助科學(xué)家對(duì)抗癌癥。

DNA螺旋的流行圖片是一條長(zhǎng)長(zhǎng)的纏繞分子線,??包含創(chuàng)造和維持生命所需的所有信息。鮮為人知的是它如何整齊地包裝和儲(chǔ)存在細(xì)胞內(nèi):DNA 纏繞在稱為組蛋白的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)周圍,形成一種稱為染色質(zhì)的優(yōu)雅、緊密堆積的結(jié)構(gòu)。為了讓分子過程實(shí)際使用該信息,染色質(zhì)“打開”,使 DNA 可用于轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,這些蛋白質(zhì)有助于將由堿基對(duì)(或“字母”)組成的 DNA 序列翻譯成信使 RNA(mRNA) .然后,該 mRNA 最終會(huì)被核糖體讀取,以根據(jù)原始藍(lán)圖生成蛋白質(zhì)。

轉(zhuǎn)錄因子 (TF) 如何與染色質(zhì)結(jié)合是生物醫(yī)學(xué)研究的重點(diǎn)。例如,許多癌癥的起源可以追溯到這個(gè)過程出錯(cuò)的時(shí)候。由東京都立大學(xué) Kouji Hirota 教授領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)一直在研究這一過程,通過觀察一種更簡(jiǎn)單的生物——裂殖酵母,重點(diǎn)研究它如何對(duì)環(huán)境變化做出反應(yīng)?,F(xiàn)在,他們成功地瞥見了酵母細(xì)胞中轉(zhuǎn)錄如何響應(yīng)周圍環(huán)境中缺乏葡萄糖的獨(dú)特機(jī)制。

當(dāng)酵母細(xì)胞饑餓時(shí),已知fbp1基因的轉(zhuǎn)錄被兩個(gè) TF,Atf1 和 Rst2 大量激活。研究小組深入研究了這個(gè)過程,發(fā)現(xiàn)兩者的激活不僅對(duì)fbp1的功能至關(guān)重要,而且它們實(shí)際上有助于穩(wěn)定彼此。.他們能夠明確地表明,這在很大程度上要?dú)w功于這些位點(diǎn)之間的距離有多近,通常僅相距 45 個(gè)堿基對(duì)。當(dāng)在位點(diǎn)之間引入額外長(zhǎng)度的 DNA 時(shí),TF 突然無法相互幫助,染色質(zhì)關(guān)閉,這兩個(gè)因素都不受約束。它們沿著螺旋的扭曲凹槽的相對(duì)方向也被證明是至關(guān)重要的。重要的是,這種效應(yīng)已被證明足以抵消 Tup11 和 Tup12 的效應(yīng),這些共同抑制因子有助于破壞獨(dú)立 TF 與染色質(zhì)的隨機(jī)結(jié)合。所有這些都表明,這種相互關(guān)系不僅有助于 TF 成功結(jié)合,而且還可以防止它們自身附著。

奇怪的是,這些 TF 是由完全獨(dú)立的化學(xué)途徑激活的。因此,該團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)的過程將這些路線整合到一個(gè)信號(hào)“樞紐”中。盡管在復(fù)雜的生化難題中是一個(gè)單一的部分,但這一發(fā)現(xiàn)有助于突出一種未被重視的機(jī)制,通過該機(jī)制,不同的 TF 相互作用并將途徑有效地整合在一起。該團(tuán)隊(duì)希望這一新見解有助于對(duì)抗癌癥和其他相關(guān)疾病。

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