佛羅里達(dá)州是美國(guó)最大的新鮮市場(chǎng)西紅柿生產(chǎn)國(guó)，占全國(guó)新鮮市場(chǎng)西紅柿的三分之一。該州炎熱潮濕的氣候使西紅柿更容易爆發(fā)細(xì)菌病原體，例如導(dǎo)致西紅柿細(xì)菌性斑點(diǎn)病的病原體，這會(huì)對(duì)產(chǎn)量產(chǎn)生不利影響。目前，一旦這種疾病開始傳播，農(nóng)民幾乎沒有辦法控制這種疾病。
為了更多地了解這種疾病，佛羅里達(dá)大學(xué)的科學(xué)家們對(duì)在佛羅里達(dá)州 70 個(gè)商業(yè)番茄田中收集的 585 株病原體進(jìn)行了表征。他們還收集了每種植物的信息，例如種子生產(chǎn)者和幼苗來源。然后他們確定了這些數(shù)據(jù)點(diǎn)之間的關(guān)聯(lián)，發(fā)現(xiàn)農(nóng)場(chǎng)和移植設(shè)施都可能是病原體傳播的重要點(diǎn)。
“我們知道佛羅里達(dá)州番茄上的病原體種群正在發(fā)生變化，但這項(xiàng)研究涵蓋了全州的許多田地，我們能夠全面了解佛羅里達(dá)州(和南喬治亞州)的病原體多樣性以及整個(gè)州的病原體多樣性。田間水平，”佛羅里達(dá)大學(xué)蓋恩斯維爾分校的植物病理學(xué)家珍妮·克萊因-戈登 (Jeannie Klein-Gordon) 說，他現(xiàn)在就讀于密歇根州立大學(xué)。
Klein-Gordon 和她的 UF 同事確定了性狀和新遺傳變異之間的遺傳關(guān)聯(lián)。他們還發(fā)現(xiàn)佛羅里達(dá)州的整體病原體種群，甚至在單個(gè)領(lǐng)域內(nèi)，都非常多樣化，表明病原體引入和傳播的多個(gè)點(diǎn)。
通過了解番茄田中病原體的數(shù)量，研究人員可以為種植者提供更有效的治療策略，并與育種者合作，以確保在未來獲得更好的栽培品種。番茄行業(yè)可以使用這些數(shù)據(jù)更有效地將管理工作集中在生產(chǎn)系統(tǒng)的入口點(diǎn)。
“據(jù)我們所知，這是對(duì)有限地理區(qū)域內(nèi)單個(gè)生產(chǎn)季節(jié)內(nèi)細(xì)菌植物病原體的最大收集和表征工作，”Klein-Gordon 說。“我們的研究表明，植物病理學(xué)家有能力將大規(guī)模調(diào)查與網(wǎng)絡(luò)分析相結(jié)合，研究病原體傳播和種群結(jié)構(gòu)。”
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