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哥廷根大學(xué)研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)出完整基因數(shù)據(jù)的新方法

導(dǎo)讀 2022年1月4日整理發(fā)布:遺傳信息的使用對(duì)于現(xiàn)代植物育種是必不可少的。盡管自 2003 年首次解碼人類基因組以來,DNA 測(cè)序已經(jīng)變得便宜得

2022年1月4日整理發(fā)布:遺傳信息的使用對(duì)于現(xiàn)代植物育種是必不可少的。盡管自 2003 年首次解碼人類基因組以來,DNA 測(cè)序已經(jīng)變得便宜得多,但收集完整的遺傳信息仍然占動(dòng)植物育種成本的很大一部分。降低這些成本的一個(gè)技巧是僅對(duì)基因組中非常小的隨機(jī)選擇部分進(jìn)行測(cè)序,并使用數(shù)學(xué)和統(tǒng)計(jì)技術(shù)完成剩余的空白。哥廷根大學(xué)的一個(gè)跨學(xué)科研究團(tuán)隊(duì)為此開發(fā)了一種新的方法論方法,該方法已發(fā)表在PLoS Genetics雜志上。

“該方法的核心思想是識(shí)別‘單倍型塊’,我們指的是基因組中由于遺傳而在不同植物中非常相似的較長(zhǎng)部分,并使用這種鑲嵌結(jié)構(gòu)來編譯其余信息,”哥廷根大學(xué)綜合育種研究中心的 Torsten Pook 博士說。“在繁殖種群中,使用這種新方法完成的序列質(zhì)量堪比從 DNA 鏈中收集的信息量的 100 倍。”作為 MAZE 項(xiàng)目的一部分,研究人員的目標(biāo)是培育不易受霜凍和干旱損害的玉米植物。該項(xiàng)目的合作伙伴 KWS Saat SE 已經(jīng)在育種計(jì)劃中使用該方法,因?yàn)樗哂谐杀拘б妗?/p>

“另一個(gè)優(yōu)點(diǎn)是,該方法不僅使我們能夠檢測(cè) DNA 鏈中單個(gè)核苷酸的差異,而且還能識(shí)別迄今為止實(shí)際上無法用于育種目的的結(jié)構(gòu)差異,”Pook 說。然而,就目前情況而言,該方法目前只能有效地用于植物育種中的自交系。一項(xiàng)后續(xù)研究已計(jì)劃將該方法擴(kuò)展到具有規(guī)則雙組染色體的生物體。這意味著他們的新方法可用于大多數(shù)脊椎動(dòng)物,包括人類。

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