蛋白質(zhì)片段識別出兩種新的極端微生物

完美適應(yīng)的微生物生活在從深海海溝到山頂?shù)臉O端環(huán)境中。更多地了解這些極端微生物如何在惡劣的條件下生存，可以讓科學(xué)家了解地球上的生命和其他行星上潛在的生命。

在《蛋白質(zhì)組研究雜志》中，研究人員詳細(xì)介紹了一種基于蛋白質(zhì)片段而不是遺傳物質(zhì)來更準(zhǔn)確地識別極端微生物的方法。該研究從智利高海拔湖泊(類似于早期火星的環(huán)境)中發(fā)現(xiàn)了兩種新的耐寒細(xì)菌。

盡管人類傾向于避免在極熱、極冷或高海拔地區(qū)定居，但一些微生物已經(jīng)適應(yīng)了在如此惡劣的地方生活。這些極端微生物引起了在其他行星上尋找生命的天體生物學(xué)家的興趣。

研究人員目前使用個體基因測序來根據(jù) DNA 識別地球上的微生物。然而，目前的方法無法區(qū)分密切相關(guān)的極端微生物物種。因此，拉爾夫·莫勒(Ralf Moeller)及其同事研究了是否可以通過使用其蛋白質(zhì)特征而不是基因序列來識別極端微生物。

研究人員開始使用來自智利高原海拔超過 2.3 英里的五個高海拔安第斯湖泊的水樣進(jìn)行演示。(作為參考，丹佛海拔約一英里。)研究人員從樣本中培養(yǎng)了 66 種微生物，然后確定兩種方法中哪一種能更好地識別微生物：

傳統(tǒng)的基因測序?qū)⒚總€樣本的 16s rRNA 基因(基于序列的微生物分析的典型基因)的核苷酸與數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比較以進(jìn)行識別。

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