Gaurav Gaiha, MD, DPhil 是 MGH、麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)拉根研究所的成員，研究艾滋病毒，人類(lèi)已知的變異最快的病毒之一。但 HIV 的變異能力在 RNA 病毒中并不是獨(dú)一無(wú)二的——隨著時(shí)間的推移，大多數(shù)病毒會(huì)發(fā)生突變，或改變其遺傳密碼。如果病毒是致病的，正確的突變可以通過(guò)改變免疫系統(tǒng)用來(lái)將病毒識(shí)別為威脅的病毒片段來(lái)使病毒逃避免疫反應(yīng)，科學(xué)家稱(chēng)之為表位。
為了對(duì)抗 HIV 的高突變率，Gaiha 和 Elizabeth Rossin 醫(yī)學(xué)博士、馬薩諸塞州眼耳科視網(wǎng)膜研究員、Brigham 將軍的成員，開(kāi)發(fā)了一種稱(chēng)為基于結(jié)構(gòu)的網(wǎng)絡(luò)分析的方法。有了這個(gè)，他們可以識(shí)別受突變限制或限制的病毒片段。突變受限表位的變化很少見(jiàn)，因?yàn)樗鼈儠?huì)導(dǎo)致病毒失去感染和復(fù)制的能力，基本上使其無(wú)法自我繁殖。
大流行開(kāi)始時(shí)，Gaiha 立即意識(shí)到將基于 HIV 結(jié)構(gòu)的網(wǎng)絡(luò)分析原理應(yīng)用于 SARS-CoV-2(導(dǎo)致 的病毒)的機(jī)會(huì)。他和他的團(tuán)隊(duì)推斷，該病毒可能會(huì)發(fā)生變異，其方式可能會(huì)使其逃避自然免疫和疫苗誘導(dǎo)的免疫。使用這種方法，該團(tuán)隊(duì)確定了突變受限的 SARS-CoV-2 表位，這些表位可以被稱(chēng)為T(mén) 細(xì)胞的免疫細(xì)胞識(shí)別。然后，這些表位可用于疫苗以訓(xùn)練 T 細(xì)胞，提供保護(hù)性免疫。最近發(fā)表在Cell 上的這項(xiàng)工作強(qiáng)調(diào)了 T 細(xì)胞疫苗的可能性，該疫苗可以針對(duì) SARS-CoV-2 和其他 SARS 樣的新出現(xiàn)和新興變體提供廣泛的保護(hù)。
從 大流行的最早階段開(kāi)始，該團(tuán)隊(duì)就知道必須為未來(lái)可能發(fā)生的突變做好準(zhǔn)備。其他實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)公布了大約 40% SARS-CoV-2 病毒的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)(藍(lán)圖)，研究表明具有強(qiáng)大 T 細(xì)胞反應(yīng)，特別是 CD8+ T 細(xì)胞反應(yīng)的患者更有可能在 COVID- 19 感染。
Gaiha 的團(tuán)隊(duì)知道這些見(jiàn)解可以與他們獨(dú)特的方法相結(jié)合：用于識(shí)別突變受限表位的網(wǎng)絡(luò)分析平臺(tái)和他們剛剛開(kāi)發(fā)的一種檢測(cè)方法，該報(bào)告目前正在Cell Reports 上發(fā)表，以識(shí)別成功靶向的表位HIV 感染者的 CD8+ T 細(xì)胞。將這些進(jìn)展應(yīng)用于 SARS-CoV-2 病毒，他們?cè)?SARS-CoV-2 中確定了 311 個(gè)高度網(wǎng)絡(luò)化的表位，這些表位可能受到 CD8+ T 細(xì)胞的突變限制和識(shí)別。
標(biāo)簽： T細(xì)胞
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