全基因組DNA甲基化圖譜揭示了膠質(zhì)母細胞瘤的影響

與血液相比，甲基化變化還導致 CD4 腫瘤浸潤 T 細胞中 341 個差異表達基因的轉(zhuǎn)錄組變化。

對參與 CD4 分化和功能的特定基因的分析揭示了腫瘤 CD4 T 細胞中TBX21、GATA3、RORC、FOXP3、IL10和IFNG 的差異甲基化狀態(tài)。

有趣的是，作者觀察到 GBM 組織中 T 細胞功能基因的幾種配體的失調(diào)，對應(yīng)于腫瘤浸潤 CD4 T 細胞中失調(diào)的 T 細胞受體。

這些 Oncotarget 結(jié)果表明 GBM 可能通過操縱腫瘤浸潤 CD4 T 細胞的分化和功能影響抗腫瘤免疫反應(yīng)，從而誘導腫瘤浸潤 CD4 T 細胞的表觀遺傳改變。

這些 Oncotarget 結(jié)果表明 GBM 可能會誘導腫瘤浸潤 CD4 T 細胞的表觀遺傳改變

來自威斯康星大學麥迪遜分校和印第安納大學醫(yī)學院的Mahua Dey 博士說：“幼稚 CD4+ 輔助 T 細胞群以其多功能性和高度可塑性的特性而聞名。”

在腫瘤微環(huán)境中，CD4 T 細胞的譜系承諾反映了腫瘤浸潤性幼稚 T 細胞內(nèi)基因表達新程序的啟動。

眾所周知，GBM 腫瘤微環(huán)境具有極強的免疫抑制性，具有多種獨特的特性，包括：

受損的細胞免疫不缺乏腫瘤浸潤性 T 細胞

常駐和循環(huán)小膠質(zhì)細胞分泌的高水平 TGFβ 和

幾種抑制性配體的表達，引起 TME 中細胞毒性淋巴細胞的無反應(yīng)性和凋亡，免疫檢查點表達，以及免疫抑制細胞浸潤增加。

全基因組甲基化測序顯示，與血液相比，GBM 患者腫瘤的 CD4 T 細胞中有 13571 個獨特的差異甲基化區(qū)域，主要集中在 TSS 周圍。

此外，將來自 RNAseq 分析的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)與 DNA 甲基化相結(jié)合，我們觀察到 GBM 腫瘤中 CD4 T 細胞(包括 Th1、Th2、Th17 和 iTregs)特異性基因集的差異甲基化，盡管具有顯著的患者間變異性。

標簽： 膠質(zhì)母細胞瘤