馬里蘭大學(xué)醫(yī)學(xué)院 (UMSOM) 的研究人員推出了一種新的在線工具,可以更快地推進(jìn)醫(yī)學(xué)發(fā)現(xiàn)以逆轉(zhuǎn)進(jìn)行性聽力損失。該工具可以輕松訪問數(shù)百項(xiàng)涉及聽力功能和耳朵的技術(shù)研究的遺傳和其他分子數(shù)據(jù)。名為基因表達(dá)分析資源 (gEAR) 的研究門戶網(wǎng)站于上個月發(fā)表在Nature Methods上的一項(xiàng)研究中公布。它由 UMSOM 基因組科學(xué)研究所 (IGS) 的一組醫(yī)生科學(xué)家與其他機(jī)構(gòu)的同事合作運(yùn)營。
該門戶允許研究人員快速訪問數(shù)據(jù)并提供易于解釋的數(shù)據(jù)集可視化??茖W(xué)家還可以輸入他們自己的數(shù)據(jù)并將其與其他數(shù)據(jù)集進(jìn)行比較,以幫助確定他們新發(fā)現(xiàn)的重要性。
“它為科學(xué)家們節(jié)省了大量時間,”研究通訊作者、UMSOM 耳鼻喉頭頸外科副教授、gEAR 創(chuàng)始人 Ronna Hertzano 醫(yī)學(xué)博士說。“研究人員不僅依賴于識別聽力損失基因的突變,還可以輕松識別耳朵中哪些細(xì)胞表達(dá)任何基因,以及這種表達(dá)如何變化,例如,由于噪音暴露或其他物種的再生過程.”
Hertzano 博士和她的團(tuán)隊(duì)最近將來自 BRAIN 計劃的數(shù)據(jù)添加到了 gEAR 門戶的一個專門領(lǐng)域,以供那些進(jìn)行神經(jīng)科學(xué)研究的人訪問,以更好地了解大腦功能和神經(jīng)退行性疾病,如阿爾茨海默氏癥。該門戶是免費(fèi)的,可供任何尋求訪問的研究人員使用。
門戶用戶可以根據(jù)自己的需要進(jìn)行各種應(yīng)用。他們可以訪問數(shù)據(jù)集上傳器并將他們的數(shù)據(jù)集添加到 gEAR 中以在私人設(shè)置中查看他們的數(shù)據(jù)。這使他們能夠在在線發(fā)布結(jié)果或提交論文以供發(fā)表之前,在其他公共數(shù)據(jù)的上下文中查看他們的發(fā)現(xiàn)。手稿發(fā)表后,手稿中可以包含一個永久鏈接,將讀者直接鏈接到該數(shù)據(jù)集的精選視圖。
“gEAR 門戶目前包括 800 多個數(shù)據(jù)集,我們在輸入之前仔細(xì)審查了這些數(shù)據(jù)集,”Hertzano 博士說。“我們目前有超過 1,200 名注冊用戶和超過 80 次研究引用?,F(xiàn)在我們的方法論文發(fā)表后,我們預(yù)計會大幅增加。”幾年前,她和她的同事對門戶進(jìn)行了軟啟動,并通過與同事的討論和科學(xué)會議上的用戶研討會來宣傳其存在。
聽力恢復(fù)項(xiàng)目是一個由聽力健康基金會資助的非營利性研究聯(lián)盟,它為 gEAR 提供了初步支持,以期更好地了解毛細(xì)胞再生的奧秘——為什么耳朵中的毛細(xì)胞在某些動物中會再生,而不會在人類中再生.當(dāng)我們的毛細(xì)胞因衰老、過度噪音或接觸某些強(qiáng)效藥物(如治療癌癥的化療藥物)而死亡時,它們不會自然再生。因此,聽力損失通常是永久性的,無法逆轉(zhuǎn)。該聯(lián)盟使用基因組分析來比較不會再生毛細(xì)胞的物種的分子過程。“gEAR 團(tuán)隊(duì)與作為我們焦點(diǎn)小組的聯(lián)盟研究人員密切互動,提供無價的反饋和建議,”Hertzano 博士說。
標(biāo)簽: 聽力損失
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