研究人員已經(jīng)鑒定出小鼠衰老過程的分子特征,并將其結(jié)果今天發(fā)布在開放獲取的eLife期刊上。
他們的分析提供了哺乳動物不同組織中不同類型細(xì)胞的衰老分子特征的最全面表征之一,并將有助于未來關(guān)于衰老和相關(guān)主題的研究。
衰老導(dǎo)致主要器官的衰落,是許多疾病(包括癌癥,心血管疾病和神經(jīng)退行性疾病)的主要危險因素。盡管先前的研究強調(diào)了衰老過程的不同特征,但潛在的分子和細(xì)胞機制仍不清楚。
為了更好地了解這些機制,塔布拉·穆里斯聯(lián)合會創(chuàng)建了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集,稱為塔布拉·穆里斯·塞尼斯(TMS)。TMS包含來自雄性和雌性小鼠的23個組織和器官的超過300,000個帶注釋的細(xì)胞。哈佛大學(xué)流行病學(xué)系博士后第一作者M(jìn)artin Jinye Zhang說:“這些細(xì)胞是從不同年齡的小鼠中收集的,這為研究跨不同組織和細(xì)胞類型的衰老的遺傳基礎(chǔ)提供了巨大的機會。波士頓。
TMS最初的研究*主要探討衰老對細(xì)胞的影響,旨在表征不同組織內(nèi)細(xì)胞類型組成的變化。在當(dāng)前以基因為中心的研究中,Zhang及其同事專注于不同細(xì)胞類型在衰老過程中發(fā)生的基因表達(dá)變化。
他們使用TMS數(shù)據(jù),從23種組織中鑒定了76種細(xì)胞類型中的衰老相關(guān)基因。然后,他們對這些基因的衰老行為進(jìn)行了表征,這些衰老行為既在所有細(xì)胞類型之間共享(“全局”)又對不同的組織細(xì)胞具有特異性。
“我們發(fā)現(xiàn)先前和當(dāng)前研究的以細(xì)胞為中心和以基因為中心的觀點是相輔相成的,因為即使在組織中細(xì)胞組成不隨時間變化的情況下,基因表達(dá)也會在同一細(xì)胞類型內(nèi)發(fā)生變化, ”舊金山Chan Zuckerberg Biohub生物信息學(xué)副主任安吉拉·奧利維拉·皮斯科(Angela Oliveira Pisco)的共同資深作者解釋說。“許多共享的衰老基因的鑒定表明,小鼠體內(nèi)存在協(xié)調(diào)的全球衰老行為。”
然后,研究小組利用這種協(xié)調(diào)的活動根據(jù)全球衰老基因制定了單細(xì)胞衰老評分。這項新的高分辨率衰老評分顯示,同一只動物中不同的組織細(xì)胞類型可能具有不同的衰老狀態(tài),從而揭示了不同類型細(xì)胞之間不同的衰老過程。
標(biāo)簽: 小鼠
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