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研究提供了一種有效的方法來挖掘內(nèi)生真菌的化學(xué)多樣性

2021-04-12 15:45:18 來源：
導(dǎo)讀 內(nèi)生真菌是具有生物活性的小分子的有前途的生產(chǎn)者。對內(nèi)生真菌丹氏青霉基因組的生物信息學(xué)分析揭示了43個生物合成基因簇，顯示出其產(chǎn)生大量

內(nèi)生真菌是具有生物活性的小分子的有前途的生產(chǎn)者。對內(nèi)生真菌丹氏青霉基因組的生物信息學(xué)分析揭示了43個生物合成基因簇，顯示出其產(chǎn)生大量次生代謝產(chǎn)物的強(qiáng)大能力。

然而，該菌株主要在不同的培養(yǎng)條件下僅以高產(chǎn)量產(chǎn)生雷巴托星，這表明大多數(shù)基因簇是沉默的。挖掘P. dangeardii中隱性基因簇的努力，包括表觀遺傳調(diào)控和一株多株化合物(OSMAC)方法，都失敗了，這可能是由于rubratoxins的高收率。

一些化合物顯示出明顯的細(xì)胞毒性，抗炎或抗氧化活性。通過生物信息學(xué)分析和途徑特異性轉(zhuǎn)錄因子的過表達(dá)來挖掘用于氮雜苯醌生物合成的有吸引力的雙重PKSs基因簇。這項研究提供了一種有效的方法來挖掘內(nèi)生真菌的化學(xué)多樣性。通過刪除用于維甲酸的生物合成關(guān)鍵基因并優(yōu)化培養(yǎng)條件的代謝分流策略，成功激活了編碼其他聚酮化合物合酶(PKS)的多個沉默基因，并導(dǎo)致了可檢測到的痕量化合物。結(jié)果，作者能夠鑒定出總共23種新化合物，包括氮雜苯甲酮單體，二聚體，具有前所未有的多環(huán)橋聯(lián)雜環(huán)和螺旋結(jié)構(gòu)的三聚體，以及鐵載體。

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