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通過大數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn)癌癥免疫反應的遺傳驅動因素

導讀 桑福德伯納姆普雷比斯醫(yī)學發(fā)現(xiàn)研究所 (SBP) 的科學家們發(fā)現(xiàn)了 100 多個影響癌癥免疫反應的新基因區(qū)域。該研究結果發(fā)表在《癌癥免疫學研...

桑福德伯納姆普雷比斯醫(yī)學發(fā)現(xiàn)研究所 (SBP) 的科學家們發(fā)現(xiàn)了 100 多個影響癌癥免疫反應的新基因區(qū)域。該研究結果發(fā)表在《癌癥免疫學研究》上,可以為未來免疫療法的發(fā)展提供信息,即增強免疫系統(tǒng)殺死腫瘤能力的治療方法。

“通過分析大型公共基因組數(shù)據(jù)庫,我們發(fā)現(xiàn)了 122 個潛在的免疫反應驅動因素——其中突變與浸潤腫瘤的免疫細胞的存在或不存在相關的基因區(qū)域,”該研究的主要作者 Eduard Porta-Pardo 博士說。 SBP 博士后研究員。“雖然其中一些對應于在免疫反應中具有已知作用的蛋白質,但許多其他蛋白質為癌癥免疫學研究提供了新方向,這可能為免疫治療指明新的靶標。”

免疫療法被譽為癌癥的轉折點,因為它甚至可以治療已擴散到其他器官的晚期病例。此類藥物目前已被廣泛使用,并且常常取得顯著的成功,可以根除或顯著縮小腫瘤并預防復發(fā)。

目前大多數(shù)免疫療法都依賴于類似的策略——釋放免疫系統(tǒng)的剎車。如果腫瘤被免疫系統(tǒng)識別為威脅并允許免疫細胞浸潤,那么這些治療方法是有效的,但一些癌癥仍然處于隱蔽狀態(tài)或以未知的方式阻止免疫細胞進入腫瘤。

“為了開發(fā)與多種癌癥相關的免疫療法,我們需要更多地了解免疫系統(tǒng)如何與腫瘤相互作用,”生物信息學和結構生物學項目教授兼主任 Adam Godzik 博士說和該研究的資深作者。“我們的研究為這一努力提供了許多新的線索。”

Porta-Pardo 評論道:“我們正在以精細的分辨率探索癌癥突變,因為突變可以以不同的方式影響編碼的蛋白質,具體取決于所產(chǎn)生的變化所在的位置。”“我們的算法,domainXplorer,可以識別表型(在本例中是腫瘤中免疫細胞的數(shù)量)與單個蛋白質結構域(具有不同功能的蛋白質部分)的突變之間的相關性。

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