在一項首創(chuàng)的實驗中，研究人員確定了 127 個基因與免疫疾病之間的聯(lián)系，為 T 細胞激活過程中基因活動的序列和時間提供了新的見解，這是調節(jié)身體免疫反應的關鍵過程。
該研究由 Open Targets、威康桑格研究所和葛蘭素史克的研究人員領導，于今天(2022 年 5 月 26 日)在Nature Genetics上發(fā)表。這是一項 3 年研究努力的結果，它首次表明在 T 細胞激活的不同階段，許多與疾病相關的變體是活躍的，為指導開發(fā)針對類風濕性關節(jié)炎等免疫疾病的新療法提供了關鍵信息，類型-1 糖尿病和克羅恩病。
T細胞是一組有助于管理人體免疫系統(tǒng)的白細胞。當 T 細胞發(fā)生故障時，它們會導致嚴重的免疫缺陷，使患者面臨感染的高風險，以及更常見的自身免疫性疾病，如 1 型糖尿病和類風濕性關節(jié)炎，身體會對自身細胞發(fā)起攻擊。
T 細胞活化是免疫系統(tǒng)對感染作出反應的第一步。在分子水平上繪制這個激活周期對于了解它可能出錯的地方以及在哪些點治療干預可以影響這個過程至關重要。但迄今為止，僅繪制了有限的激活序列快照，例如在單個時間點查看細胞。這些快照技術也無法捕獲每個階段存在的細胞亞型的多樣性。Open Targets 之前的研究表明，與免疫疾病相關的 DNA 的某些變異與 T 細胞的激活過程有關。
在這項新研究中，威康桑格研究所和葛蘭素史克的研究人員使用單細胞 RNA 測序技術對超過 650,000 個單個細胞進行了分析，以繪制 T 細胞激活過程中每個細胞亞型的基因活動時間。他們確定了受 DNA 變化調控的基因，這些基因在 T 細胞激活期間從靜止狀態(tài)到三個不同時間點在每個細胞中打開或關閉。
該團隊確定了超過 6,400 個參與激活過程的基因。通過將他們的數(shù)據(jù)與 13 種免疫疾病的已知遺傳變異進行比較，他們能夠找到與這些疾病相關的 127 個基因，其中一些僅在以前未研究過的特定時間點出現(xiàn)。
來自 Wellcome Sanger 研究所的該研究的第一作者 Blagoje Soskic 博士說：“通過分析 T 細胞激活過程中的多個時間點，我們的研究強調了基因調控可以針對特定的細胞狀態(tài)。至關重要的是，我們能夠將 DNA 變異與特定基因(尤其是細胞類型)在激活過程中不同時間的活性變化聯(lián)系起來。這種前所未有的粒度是更好地了解 T 細胞激活的關鍵，為尋求新療法提供更深入的數(shù)據(jù)用于免疫疾病。”
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