多位點多組學分析揭示了終末期卵巢癌的多種耐藥機制

由澳大利亞墨爾本 MacCallum 癌癥中心的研究人員領導的國際團隊檢查了從 15 名晚期高級別漿液性卵巢癌 (HGSC) 患者采集的約 270 個多部位尸檢樣本中的 391 個腫瘤組織。所有提供的尸檢樣本都來自最初對癌癥治療有反應但在復發(fā)時對這些療法產(chǎn)生抗藥性的患者。

該分析在不同程度上對收集的樣本使用了全基因組測序、靶向基因測序、RNA-seq、蛋白質(zhì)組學、甲基化和多色免疫熒光。研究人員尋找轉(zhuǎn)移部位內(nèi)部和之間的變異，重點關注個體患者體內(nèi)發(fā)生的耐藥機制的數(shù)量，并發(fā)現(xiàn)了從不同克隆細胞和亞克隆突變的數(shù)量到耐藥機制分布的高度變異性。

所有患者都被發(fā)現(xiàn)患有多克隆疾病，平均有 5 個克隆，從 2 個到 9 個不等。雖然癌癥可能從單克隆開始，但一個壞細胞會復制自身的克隆，擁有許多(多)克隆可能意味著癌癥來自不同細胞的多個起點。不同的起點會使評估有效的治療路徑變得更加困難，因為分化的克隆可能會產(chǎn)生不同的治療抗性。相比之下，單個克隆的存在將意味著可能能夠識別和克服的高效、單一的抗性機制的進化。

來自患者體內(nèi)空間不同位點的耐藥性相關基因的靶向測序顯示很少有共享突變，研究人員檢測到的耐藥性機制很少存在于個體的所有樣本中。他們觀察了通常是亞克隆的趨同耐藥性和耐藥機制的例子。廣泛的基因組變異性在克隆和拷貝數(shù)異常中很明顯，它們刪除或放大了大的連續(xù)代碼段。

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