新的計算機建模可以促進藥物發(fā)現(xiàn)

貝爾法斯特女王大學(xué)的科學(xué)家開發(fā)了一種計算機輔助數(shù)據(jù)工具，可以改善對一系列疾病的治療。

計算機建模工具將預(yù)測更具選擇性的潛在藥物的新結(jié)合位點，從而實現(xiàn)更有效的藥物靶向，提高治療效果并減少副作用。

數(shù)據(jù)工具或協(xié)議將揭示一類新型化合物——G 蛋白偶聯(lián)受體 (GPCR) 中的變構(gòu)藥物。

GPCR 是最大的膜蛋白家族，可在細(xì)胞內(nèi)從激素、神經(jīng)遞質(zhì)和其他內(nèi)源性分子轉(zhuǎn)導(dǎo)信號。由于它們對人體生理學(xué)的廣泛影響，GPCR 是許多治療領(lǐng)域的藥物靶點，例如炎癥、不孕癥、代謝和神經(jīng)系統(tǒng)疾病、病毒感染和癌癥。目前，超過三分之一的藥物通過 GPCR 起作用。盡管取得了巨大的治療成功，但由于混雜的結(jié)合和隨后的副作用，GPCR 藥物的發(fā)現(xiàn)具有挑戰(zhàn)性。

最近的研究指出存在其他結(jié)合位點，稱為變構(gòu)位點，藥物可以結(jié)合這些位點并提供多種治療益處。然而，變構(gòu)位點和藥物的發(fā)現(xiàn)大多是偶然的。最近確定原子和分子結(jié)構(gòu)的 X 射線晶體學(xué)和提供幾種 GPCR 3D 模型的低溫電子顯微鏡為開發(fā)計算機輔助方法以搜索變構(gòu)位點提供了機會。

研究人員開發(fā)了一種計算機輔助協(xié)議來繪制 GPCR 中的變構(gòu)位點，以期開始合理搜索變構(gòu)藥物，為一系列疾病的新解決方案和療法提供機會。

來自女王大學(xué)藥學(xué)院和資深作者的 Irina Tikhonova 博士解釋說：“我們開發(fā)了一種新穎、經(jīng)濟高效且快速的管道，用于發(fā)現(xiàn) GPCR 變構(gòu)位點，克服了當(dāng)前計算協(xié)議的局限性，例如膜變形和非特異性結(jié)合。

“我們的管道可以在短時間內(nèi)識別變構(gòu)位點，這使其適用于行業(yè)環(huán)境。因此，我們的管道是一種可行的解決方案，可以針對任何對癌癥、炎癥和中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病有影響的膜結(jié)合藥物靶點啟動基于結(jié)構(gòu)的變構(gòu)藥物搜索。”

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