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尋找最有效藥物的軟件程序有助于個性化癌癥治療

導讀 精準醫(yī)學力求使治療適應每位患者的特點。基因組研究正在提供越來越多的數據來實現這一目標,但這種非常豐富的信息阻礙了這項任務:醫(yī)生必須

精準醫(yī)學力求使治療適應每位患者的特點?;蚪M研究正在提供越來越多的數據來實現這一目標,但這種非常豐富的信息阻礙了這項任務:醫(yī)生必須解釋大量的基因改變,而只有少數與診斷每種癌癥的類型和階段有關,并決定如何對待它。

為了促進這項任務,國家癌癥研究中心 (CNIO) 的生物信息學部門和維哥大學剛剛啟動了 PanDrugs2 軟件程序,該程序生成報告以促進臨床決策。

PanDrugs2 分析每個患者的基因組數據以尋找分子靶點,換句話說,現有藥物作用于的分子。該平臺為相關基因計算一個評分系統(tǒng),為可能對它們起作用的藥物計算另一個評分系統(tǒng)。獲得最高分的藥物具有最充分的科學證據,可以有效對抗在患者體內檢測到的治療靶點。根據這些分數,該工具生成治療排名

該平臺總共處理 4,642 個基因和 14,659 種獨特化合物的數據?;谶@些信息,它在藥物和基因之間產生了 74,000 個關聯(lián)。

PanDrugs2 的開發(fā)由 CNIO 生物信息學部門負責人 Fátima Al-Shahrour 和 CINBIO 新一代信息系統(tǒng)小組研究員維哥大學的 Daniel Gonzalez Peña 共同指導。PanDrugs2 剛剛被刊登在《核酸研究》雜志上。

“PanDrugs2 旨在幫助鞏固臨床實踐中的精準醫(yī)學,”CNIO 生物信息學部門的研究員、該論文的合著者 Gonzalo Gómez-López 說。“我們一直在尋找一種清晰的顯示格式,讓專業(yè)人士非常容易理解,但仍然詳盡無遺。我們希望迄今為止所有可用的知識都可用于醫(yī)療咨詢。”

批準的、試驗的和試用的藥物

PanDrugs2 改進了五年前發(fā)布的舊版 PanDrugs 平臺。例如,它是第一個考慮遺傳(或生發(fā))突變以及受孕(或體細胞)后產生的突變的平臺。這是精準醫(yī)學的重要信息,因為遺傳突變“導致個體之間在所需藥物劑量方面的差異?;蛘邔е乱环N物質比另一種物質更有效,”Gonzalo Gómez-López 解釋說。

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