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神經(jīng)科學(xué)家發(fā)布最先進(jìn)的尖峰排序軟件

2024-04-09 11:12:58 來源: 用戶: 

研究人員如何理解通過記錄數(shù)百個(gè)神經(jīng)元同時(shí)活動(dòng)而收集到的大量數(shù)據(jù)?世界各地的神經(jīng)科學(xué)家都依賴Kilosort軟件,使他們能夠區(qū)分單個(gè)神經(jīng)元的尖峰,以了解大腦的細(xì)胞和電路如何協(xié)同工作來處理信息。

現(xiàn)在,HHMI 珍妮亞研究園區(qū)的研究人員在小組負(fù)責(zé)人 Marius Pachitariu 的帶領(lǐng)下,發(fā)布了 Kilosort4,這是流行的尖峰排序軟件的更新版本,它改進(jìn)了處理過程,需要更少的手動(dòng)工作,并且比以前的版本更準(zhǔn)確且更易于使用版本。

“在過去的八年里,我一直在完善算法,使其越來越獨(dú)立于人類,這樣人們就可以開箱即用,”Pachitariu 說。

Kilosort 已經(jīng)成為許多神經(jīng)科學(xué)家不可或缺的一部分,但如果 Pachitariu 沒有決定嘗試新的東西,它可能永遠(yuǎn)不會(huì)被開發(fā)出來。

帕奇塔留博士他的工作領(lǐng)域是計(jì)算神經(jīng)科學(xué)和機(jī)器學(xué)習(xí),但他渴望從事更多現(xiàn)實(shí)世界的應(yīng)用,在完成博士學(xué)位后,他幾乎離開學(xué)術(shù)界進(jìn)入工業(yè)界。相反,帕奇塔留選擇了倫敦大學(xué)學(xué)院肯尼思·哈里斯 (Kenneth Harris) 和馬泰奧·卡蘭迪尼 (Matteo Carandini) 的聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室做博士后,在那里他可以做更多的實(shí)驗(yàn)神經(jīng)科學(xué)。

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