圣裘德兒童研究醫(yī)院的科學家們全面鑒定了與高危兒童白血病相關的蛋白質直接調控的基因。高危白血病,特別是MLL重排(MLL-r)白血病,通常過度表達同源域轉錄因子HOXA9蛋白,目前尚無法用藥物靶向該蛋白。
這項研究為揭示 HOXA9 調控網絡和尋找 HOXA9 下游的新藥物靶點奠定了基礎,這些靶點可以構成新療法的基礎。研究結果今天(11 月 28 日)發(fā)表在《自然通訊》雜志上。
HOXA9是一種轉錄因子,是一種結合DNA來調節(jié)其他基因表達的蛋白質。HOXA9 的過度表達是許多癌癥的標志,包括高危白血病,例如 MLL-r 亞型。找到 HOXA9 調控的基因可能會破壞這種蛋白質幫??助癌癥生長和生存的方式,從而揭示治療白血病的新方法。
由于使用 HOXA9 的技術挑戰(zhàn),對該蛋白質的下游調控網絡知之甚少。St. Jude 團隊建立了一個獨特的系統(tǒng)來尋找這些受 HOXA9 調控的基因。
“我們確認了兩個主要的已知靶標,F(xiàn)LT3 和 CDK6,”通訊作者、圣猶達腫瘤細胞生物學系的 Chunliang Li 博士說。“這兩個基因都可以成為藥物的治療靶點,這在 HOXA9 過表達的臨床前模型中顯示出良好的結果。我們的結果提供了直接證據支持通過 HOXA9 對 FLT3 和 CDK6 的增強子調節(jié)。”
除了這些經過充分研究的基因之外,科學家們還發(fā)現(xiàn)了 HOXA9 結合的其他 227 個靶位點。其中許多位點位于非編碼調控區(qū)域,可能是增強子。他們與圣裘德應用生物信息學中心的計算生物學家合作進行了基于細胞的實驗,驗證了前 10 名候選者。
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