IntelliGenes 是羅格斯健康學(xué)院創(chuàng)建的首個同類軟件,據(jù)其開發(fā)人員稱,它結(jié)合了人工智能 (AI) 和機器學(xué)習(xí)方法來測量特定基因組生物標志物的重要性,以幫助預(yù)測個體疾病。
發(fā)表在《生物信息學(xué)》上的一項研究解釋了廣大用戶如何利用 IntelliGenes 來分析多基因組和臨床數(shù)據(jù)。
該研究的主要作者、羅格斯大學(xué)健康、醫(yī)療保健政策和老齡化研究所 (IFH) 的教員 Zeeshan Ahmed 表示,目前還沒有人工智能或機器學(xué)習(xí)工具可用于研究和解釋完整的人類基因組,特別是對于非專家。艾哈邁德和他的羅格斯實驗室成員設(shè)計了 IntelliGenes,以便任何人都可以使用該平臺,包括學(xué)生或那些不具備豐富的生物信息學(xué)技術(shù)知識或無法使用高性能計算機的人。
該軟件將傳統(tǒng)的統(tǒng)計方法與尖端的機器學(xué)習(xí)算法相結(jié)合,產(chǎn)生個性化的患者預(yù)測和對疾病預(yù)測具有重要意義的生物標志物的可視化表示。
在《科學(xué)報告》上發(fā)表的另一項研究中,研究人員應(yīng)用 IntelliGenes 發(fā)現(xiàn)新型生物標志物并高精度預(yù)測心血管疾病。
“數(shù)據(jù)集的融合以及人工智能和機器學(xué)習(xí)的驚人發(fā)展具有巨大的潛力,”羅伯特伍德約翰遜醫(yī)學(xué)院的醫(yī)學(xué)助理教授艾哈邁德說。
“IntelliGenes 可以支持對個體常見和罕見疾病進行個性化早期檢測,并為更廣泛的研究開辟途徑,最終帶來新的干預(yù)措施和治療方法。”
研究人員使用 Amarel 測試了該軟件,Amarel 是由羅格斯大學(xué)高級研究計算辦公室管理的高性能計算集群。該辦公室為從事復(fù)雜計算和數(shù)據(jù)密集型項目的羅格斯大學(xué)研究人員提供研究計算和數(shù)據(jù)環(huán)境。
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