科學(xué)家通過(guò)識(shí)別導(dǎo)致疾病的基因突變，在理解和開(kāi)發(fā)針對(duì)多種癌癥的治療方法方面取得了重大進(jìn)展。現(xiàn)在，由威爾·康奈爾醫(yī)學(xué)，紐約長(zhǎng)老會(huì)和紐約基因組中心(NYGC)的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了一種機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)，用于檢測(cè)具有類(lèi)似作用的DNA的其他修飾。
這項(xiàng)研究于5月10日發(fā)表在美國(guó)癌癥研究協(xié)會(huì)的《癌癥發(fā)現(xiàn)》雜志上，該研究的重點(diǎn)是對(duì)DNA的一種化學(xué)修飾，即甲基化，通常會(huì)使附近的基因沉默。這項(xiàng)新技術(shù)可以分析在腫瘤細(xì)胞中檢測(cè)到的數(shù)千種DNA甲基化變化，并推斷哪些可能推動(dòng)了腫瘤的生長(zhǎng)。
甲基化是一種“表觀遺傳”過(guò)程，通常通過(guò)改變DNA結(jié)構(gòu)而不改變基因中包含的信息來(lái)調(diào)節(jié)整個(gè)基因組中的基因活性。但是，偶爾在腫瘤抑制基因附近會(huì)發(fā)生過(guò)度的甲基化，稱(chēng)為高甲基化，使該基因沉默并有助于觸發(fā)或驅(qū)動(dòng)癌癥的細(xì)胞分裂。
如果我們可以使用類(lèi)似的技術(shù)來(lái)分析大量腫瘤，則可以繪制出導(dǎo)致某些癌癥中腫瘤生長(zhǎng)的表觀遺傳學(xué)變化。然后，我們可以使用這些信息來(lái)增進(jìn)對(duì)癌癥起源的了解，并優(yōu)化針對(duì)個(gè)別患者的治療方法。”
丹·蘭道博士(Dan Landau)，高級(jí)作者，血液學(xué)和醫(yī)學(xué)腫瘤學(xué)系醫(yī)學(xué)副教授，威爾·康奈爾醫(yī)學(xué)大學(xué)(Will Cornell Medicine)桑德拉和愛(ài)德華·邁耶(Sandra and Edward Meyer)癌癥中心的成員
新技術(shù)解決的挑戰(zhàn)與癌癥研究人員面臨的有關(guān)DNA突變的挑戰(zhàn)??相似-如何區(qū)分“驅(qū)動(dòng)程序”突變與更豐富的“乘客”突變，這些突變對(duì)癌癥沒(méi)有影響。蘭道博士說(shuō)，盡管現(xiàn)在有區(qū)分基因突變的先進(jìn)方法，但區(qū)分駕駛員甲基化變化和乘客甲基化變化的技術(shù)卻不那么復(fù)雜。蘭道博士也是紐約市政府的核心成員，也是紐約的一名腫瘤學(xué)家。 -長(zhǎng)老會(huì)/威爾康奈爾醫(yī)學(xué)中心。
Landau博士團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)的新算法稱(chēng)為MethSig。它使用可用信息，例如基因組特定區(qū)域中的甲基化背景速率，來(lái)估計(jì)何時(shí)給定的甲基化變化可能是癌癥的驅(qū)動(dòng)因素。
標(biāo)簽： 機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)
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