紐約(2021年5月26日)-根據(jù)國(guó)際MetaSUB聯(lián)盟(International MetaSUB Consortium)的一項(xiàng)研究，從2015年至2017年，從未從全球公共交通系統(tǒng)和醫(yī)院的采樣中收集到大約12,000種細(xì)菌和病毒。由Weill Cornell Medicine研究人員領(lǐng)導(dǎo)的跟蹤微生物的工作。
這項(xiàng)研究于5月26日發(fā)表在《細(xì)胞》雜志上，國(guó)際研究人員在三年期間內(nèi)，在32個(gè)國(guó)家和六大洲的60個(gè)城市中收集了近5,000個(gè)樣本。研究人員使用稱為shot彈槍測(cè)序的基因組測(cè)序技術(shù)分析了樣品，以檢測(cè)各種微生物的存在，包括細(xì)菌，古細(xì)菌(不同于細(xì)菌的單細(xì)胞生物)以及使用DNA作為其遺傳物質(zhì)的病毒。(使用大流行前研究中使用的DNA分析方法無(wú)法檢測(cè)到其他以RNA為遺傳物質(zhì)的病毒，例如SARS-CoV-2(引起的病毒)。)
該研究領(lǐng)域?qū)τ跈z測(cè)已知和未知感染的暴發(fā)以及研究不同城市環(huán)境中抗生素耐藥性微生物的流行具有重要意義。
高級(jí)作者克里斯托弗·梅森(Christopher Mason)博士說(shuō)：“每次坐在地鐵上時(shí)，您都可能會(huì)與一個(gè)全新的物種通勤。” 。Mason博士還是Biotia和Onegevity Health的聯(lián)合創(chuàng)始人和付費(fèi)顧問(wèn)，以及WorldQuant LLC的付費(fèi)發(fā)言人。
當(dāng)前的研究導(dǎo)致發(fā)現(xiàn)了10928病毒和748細(xì)菌，這是任何參考數(shù)據(jù)庫(kù)中都沒(méi)有的。
Mason博士與Evan Afshin博士于2015年共同創(chuàng)立了MetaSUB(地鐵和城市生物群落的Metagenomics和Metadesign的縮寫)，Evan Afshin博士當(dāng)時(shí)是皇后學(xué)院的Maclaylay榮譽(yù)學(xué)院的本科生，現(xiàn)在是生理學(xué)和生物物理學(xué)的臨床研究員在威爾·康奈爾大學(xué)(Will Cornell Medicine)就職，并是Onegevity Health的付費(fèi)顧問(wèn)。新發(fā)布的研究由Drs。Dr.領(lǐng)導(dǎo)。梅森，戴維·丹科(David Danko)是研究期間梅森博士實(shí)驗(yàn)室的威爾·康奈爾大學(xué)研究生院博士生，當(dāng)時(shí)是威爾·康奈爾醫(yī)學(xué)大學(xué)計(jì)算生物醫(yī)學(xué)的研究助理Daniela Bezdan。
通過(guò)收集微生物樣本并分析它們的基因(統(tǒng)稱為微生物組)，研究人員希望能更多地了解人類中存在的細(xì)菌，病毒和其他微生物。例如，這項(xiàng)研究可能有助于確定抗生素抗性菌株的出現(xiàn)。僅從遺傳序列預(yù)測(cè)抗生素抗性就具有挑戰(zhàn)性，但是研究人員能夠繪制一些已知與抗性相關(guān)的基因，量化其豐度并確認(rèn)遺傳標(biāo)記賦予抗性的能力。他們發(fā)現(xiàn)，某些城市的抗病基因比其他城市更多，并且其中一些基因可能具有城市特有的特征。
標(biāo)簽： 微生物組
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