今天和 100 年前一樣,醫(yī)生通過從患者身上采集組織樣本來診斷癌癥,他們通常將這些樣本固定在福爾馬林中進行顯微鏡檢查。在過去的 20 年中,還建立了遺傳方法,可以更詳細地表征腫瘤中的突變,從而幫助臨床醫(yī)生選擇最佳治療策略。
即使是微小的組織樣本也可用于檢測蛋白質(zhì)
現(xiàn)在,來自亥姆霍茲協(xié)會 (MDC) 的柏林 Max Delbrück 分子醫(yī)學中心、柏林衛(wèi)生研究所 (BIH)、柏林慈善大學和德國癌癥協(xié)會 (DKTK) 的一組研究人員成功地分析了使用質(zhì)譜儀詳細分析固定肺癌組織樣本中的 8,000 多種蛋白質(zhì)。
“使用我們開發(fā)的方法,可以在蛋白質(zhì)水平對癌細胞中的分子過程進行深入分析 - 并且可以在日常臨床實踐中大量收集和存儲的存檔患者樣本中進行分析,”MDC 和 BIH 蛋白質(zhì)組學平臺負責人 Philipp Mertins 博士說。“即使是非常小的組織樣本,例如通過穿刺活檢獲得的組織樣本,也足以進行我們的實驗。”
該研究發(fā)表在《自然通訊》雜志上,被認為是德國聯(lián)邦教育和研究部 (BMBF) 資助的多模態(tài)臨床質(zhì)譜靶向治療抗性 (MSTARS) 研究項目的重大成功。自 2020 年以來,總收入約為 570 萬歐元。
由 Mertins 和 Charité 病理學研究所的 Frederick Klauschen 教授領導的研究小組已經(jīng)能夠證明蛋白質(zhì)——與經(jīng)常研究但非常敏感的 RNA 分子不同——在樣品中保持穩(wěn)定多年,并且可以精確地量化。“此外,存在于腫瘤組織中的蛋白質(zhì)尤其能很好地映射疾病進展,”主要作者、默廷斯和克勞申實驗室的博士生科琳娜弗里德里希說。“這是因為它們提供了一些信息,例如哪些促進或抑制腫瘤生長的基因在細胞中特別活躍。”
這些方法有望幫助確定每種腫瘤的最佳治療方法
從該團隊對兩種肺癌——腺癌和鱗狀細胞癌——的分析中獲得的圖片也變得如此詳細,因為研究人員不僅發(fā)現(xiàn)了細胞中存在的大量蛋白質(zhì),而且還量化了超過 14,000磷酸鹽。在磷酸化的幫助下,磷酸化是一種調(diào)節(jié)磷酸基團與蛋白質(zhì)可逆連接的機制,細胞通過打開或關閉某些信號通路來控制幾乎所有的生物過程。
標簽: 腫瘤組織
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