馬里蘭州沃爾特·里德陸軍研究所領導的研究證實了之前針對HIV-1的宿主限制因素的研究結(jié)果。在《科學轉(zhuǎn)化醫(yī)學》雜志上發(fā)表的一篇題??為“單細胞轉(zhuǎn)錄組學識別體內(nèi)HIV-1胸腺肽α限制”的論文中,作者詳細介紹了組學如何在尋找治療策略中揭示相關性。
使用單細胞轉(zhuǎn)錄組學來鑒定14名HIV-1感染患者細胞中的活性蛋白質(zhì)。研究小組通過將患者基因表達與單個細胞內(nèi)的病毒RNA(vRNA)數(shù)量相關聯(lián),縮小了稱為宿主限制因子的潛在抗病毒蛋白列表。這些蛋白質(zhì)是人體先天免疫系統(tǒng)的一部分,可以識別并干擾病毒復制周期的特定步驟,從而阻止感染。
研究小組還比較了血漿病毒載量最高的參與者的測序,結(jié)果發(fā)現(xiàn)vRNA轉(zhuǎn)錄與編碼胸腺肽αα(ProTα)的基因PTMA的表達呈負相關。
隨后在初始研究之外的28名其他參與者中驗證了這種關聯(lián)。胸腺素α原的體外過度表達證實該細胞因子抑制HIV-1轉(zhuǎn)錄和感染性病毒的產(chǎn)生。
研究人員發(fā)現(xiàn)個體免疫細胞中的HIV-1RNA(vRNA)與特定的臨床測量結(jié)果相關。通過單細胞分析,研究人員鑒定了急性HIV感染(AHI)和抗逆轉(zhuǎn)錄病毒治療(ART)階段參與者的帶有vRNA的細胞。
vRNA+細胞主要存在于CD4+T細胞亞群中。相關性分析顯示,vRNA+CD4+T細胞的頻率與總細胞相關HIV-1DNA和血漿病毒載量等指標呈正相關。這表明這些細胞中vRNA的存在具有生物學意義,并且與HIV-1臨床參數(shù)相關。
為了證實該方法,紐約西奈山醫(yī)學院的研究人員在17年前發(fā)現(xiàn)了突出顯示的ProTαHIV-1限制,并在一篇論文“ProthymosinAlpha作為人類有效抑制劑的新功能”中進行了描述。原代巨噬細胞中的免疫缺陷病毒1型基因表達,”發(fā)表在《病毒學雜志》上。
先前的研究還觀察到人類T細胞感染HIV-1與可檢測到的ProTαmRNA量減少有關。西奈山的研究發(fā)現(xiàn),ProTα活性以劑量依賴性方式顯著抑制原代巨噬細胞中的HIV-1復制,但對CD4+T細胞中的HIV-1幾乎沒有影響。
目前的研究展示了使用公正的組學技術來識別潛在的抗病毒因子,例如HIV-1的ProTα和其他病毒預防和治療策略。
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