對來自 23 個國家的 10,000 多種不同的結核分枝桿菌細菌分離物進行的大規(guī)模分析揭示了與對 13 種一線和二線新抗生素和再利用抗生素的耐藥性相關的新基因。這項工作由結核病綜合耐藥性預測:一個國際聯(lián)盟 (CryPTIC) 進行,在 8 月 11日發(fā)表在開放獲取期刊PLOS Biology上的兩篇新論文中進行了描述。
結核病 (TB) 是一種可治愈和可預防的疾病;85% 的受影響者可以通過六個月的藥物治療成功。盡管如此,近年來結核病導致的死亡人數(shù)比其他傳染病還多,耐藥結核病是一個持續(xù)的威脅。更好地了解賦予抗生素耐藥性的結核分枝桿菌變體對于更好地監(jiān)測耐藥菌株以及開發(fā)新藥都很重要。
在第一篇新論文中,研究人員概述了他們如何收集 12,289 個結核分枝桿菌分離株的開放獲取數(shù)據(jù)綱要,并在世界各地的 CryPTIC 合作伙伴實驗室進行處理。對每個分離株進行測序,然后在具有不同濃度的 13 種抗菌劑的高通量網(wǎng)格上進行測試。在該綱要收錄的樣本中,6,814 個樣本對至少一種藥物耐藥,其中 4,685 個樣本對多種藥物或一線治療利福平耐藥。
在第二篇論文中,該聯(lián)盟利用 10,228 個結核分枝桿菌分離株的數(shù)據(jù)展示了他們在全基因組關聯(lián)研究 (GWAS) 中的發(fā)現(xiàn)。對于所有 13 種藥物,該小組發(fā)現(xiàn)了與最小抑制濃度顯著增加相關的未分類變體——即阻止結核分枝桿菌生長的抗生素的最低濃度。分析這種濃度,而不是二元耐藥或不耐藥結果,可以識別出僅導致抗生素反應發(fā)生細微變化的變體,這些變化可以通過增加藥物劑量來克服。研究人員選擇了對每種藥物產(chǎn)生耐藥性的 20 個最重要的基因,并更深入地描述了這些特定基因的效應大小和變化。
“我們的研究證明了全球合作伙伴關系能夠顯著提高我們對與結核分枝桿菌耐藥性相關的遺傳變異的認識,”作者指出。
總之,這些論文不僅揭示了可以跟進的特定基因,以更好地了解結核分枝桿菌的耐藥性,而且還為未來病原體研究提供了框架。
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